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L’aquila, da sempre simbolo di questa comunità, era dei Conti Palatini di Bergamo, che attorno al IX secolo, in seguito alla crescente affermazione dell’autorità vescovile all’interno della città, furono costretti a spostarsi a Martinengo, dove eressero un castello. In seguito, cominciarono a denominarsi Da Martinengo. Gli abitanti del paese, per il senso di gratitudine verso i loro feudatari, adottarono l’emblema facendolo dipingere sulla facciata del municipio. Nonostante l’antichità dello stemma — una sua delineazione si trova nello stemmario del Camozzi — il Comune non ne ha mai regolarizzato e chiesto la concessione. Soltanto quando ottenne il titolo di città nel 2011, l’amministrazione decise di chiedere la formale approvazione degli emblemi civici secondo i termini di legge.
Dopo delibera di consiglio comunale del 21 maggio 2012, con a capo il sindaco Paolo Nozza, sì arrivò finalmente alla configurazione attuale dello stemma: l’aquila con gli occhi, il becco e gli artigli smaltati di nero e una corona all’antica d’azzurro, cioè una corona di metallo non impreziosita da pietre o gemme. Lo scudo è completato dal motto su una lista terminante con due punte e svolazzante alla base dello scudo con la scritta MAGNIFICA COMMUNITAS MARTINENGHI.
Per completezza di informazioni, si deve notare che in un antico stemmario medievale, il Trivulziano, è presente uno stemma attribuito alla comunità di Martinengo; vi è effigiata una stella di rosso ad otto punte su fondo oro.